Lord Commander Militant, İM birimlerinin sektör ve alt-sektörlerdeki en üst rütbedeki yöneticisidir. Genelde büyük kararlar sektör bazında verildiğinden bu rütbedeki subayların omzuna büyük yükler düşer. Lord Commander savaşta kendini göstermiş generaller arasından seçilse de, bazı daha sakin sektörlerde politik bağlantıları iyi olan bir gezegen soylusu da Lord Commander olabilir.

Alay/Regiment, İM’nin en temel birimidir. Space Marine chapterlarının aksine İM alayları sabit değildir ve ihtiyaca göre düzenlenirler. Bütün alay mevcudu aynı gezegenden seçilerek dil, lehçe ve kültür farklılıklarının önüne geçilmeye çalışılır. Her gezegenin alay yapısı ve mevcudu birbirinden farklı olsa da, belli başlı İM kuralları bütün gezegenlerde uygulanır. Alaylar genelde kuruldukları gezegenden çok uzakta savaştıklarından mevcutları yenilenmez ve gittikçe daha küçük hale gelirler. Bir sefer sırasında mevcutları çok azalmış farklı alaylar birleştirilip tek bir alay yapılabilir. Alaylar büyüklüklerine göre albay-yarbay-binbaşı seviyesinde bir komutan ve onun komuta mangası tarafından yönetilirler. Alay yönetiminde genelde komiser, donanma iletişim subayı, rahip gibi yan unsurlar da bulunur.

Alaylar, bölük/company seviyesinde alt bölümlere ayrılırlar. Her bölük yüzbaşı-teğmen arası bir seviyede bir komutan ve onun komuta mangası tarafından yönetilir. Bölüklerdeki müfreze/platoon ve onun altındaki manga/squad sayısı ve içeriği gezegenden gezegene değişse de, 10 kişilik manga düzeni çoğu gezegende kabul edilmiştir.

Ortalama İM askerleri, ilkokul ve aşağısı seviyede eğitimli, IQ’su 40-80 arasında gezinen, sıkı bir dini/askeri doktrinasyondan geçirilmiş 16-40 yaş arası bireylerdir. Hayatları İmparator’a ait olduğundan harcanabilirdirler. Ekipmanları gezegenden gezegene değişse de en temel muhafız ekipmanları şöyledir:

• Flak zırh ve miğfer: Bu zırh imparatorluk içinde bulunan en temel mermili ve lazer silahlara karşı koruma sağlasa da, birçok ırkın silahlarına karşı etkisizdir.
• Lasgun: Günümüz piyade tüfeklerine yakın bir güce sahip olan bu lazer tüfeğinin üretimi kolaydır, bataryaları bol bulunur ve kolay şarj edilir.
• İmparatorluk Muhafızının El Kitabı: Bu kitapta askeri kurallar, okunması gereken dualar, ilk yardım bilgileri, düşmanlar hakkında temel bilgiler gibi detaylar vardır. Ağır bir propaganda diliyle yazılmış olması ve askere cesaret vermek için yalanlarla dolu olması ile ünlü bir kitaptır.

Elit veya Özelleşmiş Mangalar

İmparatorluk Muhafız gelenekleri zaman içerisinde standart piyade mangasının dışında kalan özelleşmiş birçok manga türü oluşturmuştur:

• Özel silah mangaları: 6 kişilik olan bu mangalar genelde plazma, melta veya alev silahlarıyla donatılır ve ellerindeki silahların etkili olduğu düşman tiplerine karşı daha etkili bir biçimde kullanılır. Bu tarz bazı mangaların keskin nişancı tüfekleri ve ağır patlayıcılar kullanan versiyonları da savaş alanlarında görülmüştür.
• Ağır silah mangaları: 6 kişi ve 3 ağır silahtan oluşurlar, 3 kişi nişancı, 3 kişi taşıyıcı görevindedir. Genelde ağır makinalı, roketatar, 20mm otomatik top, lazer topu gibi silahlar taşırlar ve uzaktan atış desteği ve baskılama için kullanılırlar.
• Psişik mangalar: Zayıf psişik özelliklere sahip olan bu askerler güçlerini birleştirip tek bir psişik gibi davranabilirler.
• Ceza mangaları: Ölüm mahkumlarını barındıran ve en tehlikeli işlere gönderilen bu mangalar bazen birleştirilip ceza alayları haline getirilebilir.
• Ogryn mangaları: Ogrynler, İmparatorluğun izin verdiği az sayıda mutant türünden biridir. Normal insanın iki katından daha büyük olan bu çirkin devler aşırı derecede aptal olduklarından kullanımı çok kolay ve yakın dövüşte kırılmayacak silahlarla donatılırlar.
• Ratling mangaları: Tıpkı Ogrynler gibi ratlingler de becerileri sayesinde kendilerine orduda yer bulmuş mutantlardır. Keskin nişancılık ve aşçılık yetenekleri en üst düzeyde olan ratlingler hırsızlık ve oburlukları yüzünden lojistik subaylarınca hiç sevilmezler.
• Stromtrooperlar: Schola Progenium tarafından eğitilmiş ve İM imkanları çerçevesinde en iyi ekipmanla donatılmış askerlerdir. Genelde ileri bir lasgun modeli olan hellgun kullanırlar. Daha zırhlıdırlar ve kaskları elektronik sistemlerle donatılmıştır.
• Süvari Mangaları: İmparatorluktaki milyonlarca farklı gezegende binlerce farklı binek hayvanı kullanılır. En yaygın süvari türü atlı süvari olsa da, daha egzotik hayvanlara ve motorsikletlere binen süvari mangaları da vardır. Bu askerlerin bir kısmı hayvanlarının çenelerini veya patlayıcı bağladıkları mızrakları yakın dövüşte kullanırken kalanları mobilitelerini savaş alanında hızlı yer değiştirmek için kullanır.